Nagasaki está localizada bem ao sul do Japão, na ilha de Kyushu. Em geral, a cidade possui temperaturas amenas durante o ano inteiro, por isso pode ser visitada em qualquer período, mas cada estação possui a sua particularidade e suas atrações específicas que são mais aproveitadas em cada época específica. Tudo vai depender do interesse de cada viajante.
Pela sua localização mais ao sul do Japão, o inverno é menos rigoroso e não chega a nevar. O inverno que corresponde aos meses de dezembro janeiro e fevereiro, é também o período de baixa temporada, sem tantos turistas pelas ruas e sem muitas filas nas atrações turísticas. O outono que corresponde aos meses de setembro, outubro e novembro, possui uma temperatura bem agradável e é conhecido pela folhagem colorida, com folhas que variam em tons de vermelho, amarelo e laranja. A temperatura é um pouco mais fria no começo e no final do dia. A primavera é a estação mais esperada pelos japoneses devido à floração das cerejeiras. Assim como acontece no outono, a temperatura também é muito agradável. O verão é obviamente a estação mais quente do ano, que corresponde aos meses de junho, julho e agosto. Com dias mais longos, Nagasaki recebe mais turistas nesse período, considerado alta temporada, assim como acontece em todo o Japão, afinal é quando japoneses e turistas de outras partes do mundo viajam pelo país.